本發明公開了一種地下水監測系統，其包括：監測管道，安裝于監測井中；多個分隔板組，間隔設置在監測管道內，包括第一分隔板與位于其下方的第二分隔板，每一個分隔板組與監測管道內壁構成一個取樣空間，兩個相鄰的分隔板組與監測管道內壁構成置物空間，監測傳感器組設在取樣空間，取樣空間設有取樣口；多個泵，設于置物空間中，其進水端連通泵下端的取樣空間；集成取樣管道，包括外管和設置其內部的多個取樣管，取樣管與泵一一對應，取樣管的一端穿過置物空間與泵的出水端相連；集成線路管道，設置在監測管道內，用于連接泵和工作站以及監測傳感器組和控制終端。本發明的地下水監測系統自動化程度高，能對不同層地下水進行自動抽取和實時監測。