本發明公開了一種蘆葦虉草群落中兩物種互補利用土壤養分的確定方法，屬于植物垂直分布中土壤養分資源高效利用領域。包括如下步驟：分別選擇單生虉草種群和單生蘆葦種群，動態測量兩物種種群下不同層次土壤有效氮（銨態氮和硝態氮）和有效磷含量一年中的動態變化，并結合兩物種的生長動態差異和根系分布差異，估算出蘆葦種群和虉草種群對土壤有效氮和有效磷的補償利用率，即兩物種對土壤養分資源的互補利用情況。本發明簡便易行，數據準確、穩定，可應用于具有垂直分布特征群落土壤中植物的養分互補利用的確定。